在发酵工业生产中，发酵系统只允许生产菌存在和生长繁殖，不允许其他的微生物共存，因此，所有的发酵过程都要进行纯种培养。若其他杂菌一旦侵入生产系统，轻者短期内会和生产菌争夺养料，严重者则会终止发酵，进倒灌处理。
干热灭菌法是在干燥环境下用高温杀死细菌和细菌芽胞的技术。主要用于不能耐受湿热蒸气的物品，如必须保持干燥的化学物品，有刃器械如刀、剪之类，无水的油剂、油膏、甘油等。干热灭菌法所需温度较高，时间较长。常用温度是160℃，持续2h。干热最适用于玻璃器皿的灭菌，尤其是玻璃注射器等。常见的干热灭菌法有如下几种：
(1)焚烧：用火焚烧是一种彻底的灭菌方法，破坏性大，仅适用于废弃物品或动物尸体等。(2)烧灼：直接用火焰灭菌，适用于实验室的金属器械（镊、剪、接种环等）、玻璃试管口和瓶口等的灭菌。
(3)干烤：在干烤箱（hot air sterilizer）内进行，加热至160℃～170℃维持2小时，可杀灭包括芽胞在内的所有微生物。适用于耐高温的玻璃器皿、瓷器、玻质注射器等。
(4)红外线：红外线辐射是一种0.77-1000微米波长的电磁波，有较好的热效应，尤以1-10微米波长的热效应最强。亦被认为一种干热灭菌。红外线由红外线灯泡产生，不需要经空气传导，所以加热速度快，但热效应只能在照射到的表面产生，因此不能使一个物体的前后左右均匀加热。红外线的杀菌作用与干热相似，利用红外线烤箱灭菌的所需温度和时间亦同于干烤。多用于医疗器械的灭菌。
(5)微波：微波是一种波长为1毫米到1米左右的电磁波，频率较高，可穿透玻璃、塑料薄膜与陶瓷等物质，但不能穿透金属表面。微波能使介质内杂乱无章的极性分子在微波场的作用下，按波的频率往返运动，互相冲撞和摩擦而产生热，介质的温度可随之升高，因而在较低的温度下能起到消毒作用。一般认为其杀菌机理除热效应以外，还有电磁共振效应，场致力效应等的作用。消毒中常用的微波有2450MHZ与915MHZ两种。微波照射多用于食品加工。在医院中可用于检验室用品、非金属器械、无菌病室的食品食具、药杯及其它用品的消毒。
湿热灭菌法是一种利用高温和湿润条件灭菌的方法，主要使用高压蒸汽、沸水或流通蒸汽进行灭菌。这种灭菌方法的原理是利用高温水蒸气的潜热，使蛋白质和核酸变性，最终导致微生物的死亡。与干热灭菌法相比，湿热灭菌法更容易使蛋白质变性或凝固，因此具有更高的灭菌效率。
湿热灭菌法通常在饱和蒸汽或沸水或流通蒸汽中进行，温度较高，湿度较大，因此具有更强的穿透力，能够更好地渗透到物品内部，达到更好的灭菌效果。常见的湿热灭菌方法包括以下几种：
(1)煮沸灭菌法：将水煮沸至100℃，然后将需要灭菌的物品放入水中，保持15-20分钟，直到达到灭菌效果。
(2)巴氏消毒法：将需要灭菌的液体加热至68℃左右，保持15-30分钟，以杀死其中的病原菌。
(3)高压蒸汽灭菌法：将需要灭菌的物品放在高压蒸汽锅中，通过加压高温蒸汽进行灭菌，通常在121℃下保持20-30分钟。
(4)流通蒸汽灭菌法：将需要灭菌的物品放在流通蒸汽灭菌器中，在100℃左右的蒸汽中进行灭菌，通常保持15-30分钟。
(5)间歇蒸汽灭菌法：将需要灭菌的物品放在普通的蒸锅中，加热至100℃后保持一段时间，然后停止加热，待温度降至60℃以下后再次加热，如此反复进行，以达到灭菌效果。
以上几种湿热灭菌方法在不同的场合和情况下有不同的应用，需要根据具体情况进行选择。其中，高压蒸汽灭菌法是最常用的方法之一，具有灭菌彻底、操作简单、可靠等优点。
3、辐射灭菌
辐射灭菌是利用高能量的电磁辐射和微粒辐射来杀死微生物，以紫外线最常用。紫外线对芽孢和营养细胞都能起作用，但细菌芽孢和霉菌孢子对紫外线的抵抗力强。紫外线的穿透力低，且距照射物不超过1.2 m；对固体物料灭菌不彻底，也不能用于液体物料的灭菌。它们都能通过特定的方式控制微生物生长或杀死微生物。
常见的辐射灭菌方法有以下几种：
(1)电子束辐射灭菌（E-beam）：该方法使用高能电子束穿透物品，从而杀死其中的微生物。该方法常用于医疗器械、食品、药品等的灭菌。
(2)γ 射线辐射灭菌（Gamma）：该方法使用γ射线穿透物品，从而杀死其中的微生物。该方法常用于食品、药品等的灭菌。
(3)X射线辐射灭菌（X-ray）：该方法使用X射线穿透物品，从而杀死其中的微生物。该方法常用于医疗器械、食品、药品等的灭菌。
(4)紫外线辐射灭菌（UV）：该方法使用特定波长的紫外线照射物品，从而杀死其中的微生物。该方法常用于空气、水、表面等的消毒。
以上几种辐射灭菌方法具有不同的适用范围和优缺点，需要根据具体情况进行选择。其中，电子束辐射灭菌和γ射线辐射灭菌在医疗器械、食品、药品等领域应用较为广泛。
在生物实验室中，常常需要使用化学试剂进行灭菌。其中，常见的化学试剂包括环氧乙烷、β-丙内酯和甲醛蒸汽等。这些化学试剂具有不同的物理和化学性质，并且在不同的应用场景中具有不同的优缺点。
环氧乙烷是一种无色易燃的有机化合物，具有醚类气味。它是一种优良的消毒剂，环氧乙烷的灭菌原理是通过与微生物的蛋白质、核酸等生物分子发生反应，破坏其结构和功能，从而杀死微生物。环氧乙烷的优点是消毒效果不受环境温度、湿度和微生物种类等影响，因此被广泛应用于各种场所的消毒。但是，环氧乙烷对皮肤、眼睛和呼吸系统等具有刺激作用，因此需要注意个人防护。
β-丙内酯是一种无色易溶于水的有机化合物，具有芳香气味。它是一种高效、广谱的灭菌剂，通过与微生物的细胞膜发生反应，破坏其结构和功能，从而杀死微生物。β-丙内酯的优点是消毒效果不受环境温度、湿度和微生物种类等影响，因此被广泛应用于各种场所的消毒。但是，β-丙内酯对眼睛、皮肤和呼吸系统等具有刺激作用，因此需要注意个人防护。
使用方法：将需要消毒的物品放在密闭的容器中，用β-丙内酯气体进行消毒。消毒时间通常为2-4小时，取决于物品的大小和厚度等因素。在消毒过程中，需要保持良好的通风和防止火源。
甲醛是一种无色易溶于水的有机化合物，具有刺激性气味。它是一种传统的灭菌剂，通过与微生物的蛋白质、核酸等生物分子发生反应，破坏其结构和功能，从而杀死微生物。甲醛的优点是消毒效果不受环境温度、湿度和微生物种类等影响，因此被广泛应用于各种场所的消毒。但是，甲醛对眼睛、皮肤和呼吸系统等具有刺激作用，因此需要注意个人防护。同时，甲醛蒸汽在遇到明火或高温时会发生爆炸，因此需要避免火源。
综上所述，以上方法为灭菌的常用方法,依据自身条件来选择适合的方法，因为灭菌对象不同,地域的不同,季节的不同,海拔的高低，所应用的方法都不尽相同,所以选择合适的灭菌方法,对发酵生产及生产力的提高是至关重要的。
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